Akvariumo filtro valymas yra kiek kita tema. Pastebėtina, kad užpildų ir filtrų valymas akvariumo vandeniu teoriškai ir praktiškai gali būti naudingesnis nei valymas naudojant krano vandenis, ypač jei akvariumo ir krano vandenys labai skiriasi. Esmė, kad susiduriama su mikroorganizmais ir kita fauna kuri gyvena filtre, o ši yra gan jautri visokiems dalykams, vanduo aišku vienas jų. Turiu omeny apie veikiančio akvariumo veikiančio filtro valymą. Jei ketinama filtrą ,,padėti į dėžę ateičiai", tai tuomet nėra svarbu koks vanduo yra naudojamas.